Protein–RNA interactions for Protein: Q60664

Lrmp, Lymphoid-restricted membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LrmpQ60664 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LrmpQ60664 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LrmpQ60664 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LrmpQ60664 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LrmpQ60664 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LrmpQ60664 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LrmpQ60664 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LrmpQ60664 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LrmpQ60664 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LrmpQ60664 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LrmpQ60664 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LrmpQ60664 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LrmpQ60664 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LrmpQ60664 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LrmpQ60664 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LrmpQ60664 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LrmpQ60664 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LrmpQ60664 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LrmpQ60664 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LrmpQ60664 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LrmpQ60664 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms