Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms