Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc5a6Q5U4D8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms