Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnajc11Q5U458 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms