Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Specc1Q5SXY1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms