Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW46

Lpo, Lactoperoxidase, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LpoQ5SW46 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LpoQ5SW46 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LpoQ5SW46 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms