Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam71bQ5STT6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms