Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d1Q5SSN7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms