Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms