Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim58Q5NCC9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms