Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1810065E05RikQ5NC41 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1810065E05RikQ5NC41 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms