Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q5EBG8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Q5EBG8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q5EBG8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q5EBG8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q5EBG8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q5EBG8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q5EBG8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms