Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT8

Pnma5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma5Q5DTT8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pnma5Q5DTT8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pnma5Q5DTT8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pnma5Q5DTT8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pnma5Q5DTT8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pnma5Q5DTT8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pnma5Q5DTT8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pnma5Q5DTT8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms