Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CenpjQ569L8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CenpjQ569L8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms