Protein–RNA interactions for Protein: Q504N7

Pyrin and HIN domain-containing protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q504N7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q504N7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q504N7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q504N7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q504N7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q504N7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q504N7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q504N7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q504N7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q504N7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q504N7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q504N7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q504N7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q504N7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q504N7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q504N7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q504N7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q504N7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q504N7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q504N7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q504N7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q504N7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q504N7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q504N7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q504N7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q504N7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q504N7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q504N7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q504N7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q504N7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q504N7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q504N7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q504N7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q504N7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q504N7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q504N7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q504N7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q504N7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q504N7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q504N7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q504N7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q504N7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q504N7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q504N7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q504N7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q504N7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q504N7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q504N7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q504N7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q504N7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q504N7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q504N7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q504N7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q504N7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q504N7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q504N7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q504N7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q504N7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q504N7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q504N7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q504N7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q504N7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q504N7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q504N7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q504N7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q504N7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q504N7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q504N7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q504N7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q504N7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q504N7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q504N7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q504N7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q504N7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q504N7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q504N7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q504N7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q504N7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q504N7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q504N7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q504N7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q504N7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q504N7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q504N7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q504N7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q504N7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q504N7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q504N7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q504N7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q504N7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q504N7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q504N7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q504N7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q504N7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q504N7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q504N7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q504N7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q504N7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q504N7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q504N7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms