Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thsd4Q3UTY6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms