Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Obox3Q3UT54 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms