Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BB287469Q3UT53 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms