Protein–RNA interactions for Protein: Q3USY0

Slc38a11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a11Q3USY0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a11Q3USY0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a11Q3USY0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a11Q3USY0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a11Q3USY0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a11Q3USY0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a11Q3USY0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a11Q3USY0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a11Q3USY0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a11Q3USY0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a11Q3USY0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a11Q3USY0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc38a11Q3USY0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc38a11Q3USY0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc38a11Q3USY0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc38a11Q3USY0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms