Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6899Q3USS0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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