Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fchsd2Q3USJ8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Fchsd2Q3USJ8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fchsd2Q3USJ8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fchsd2Q3USJ8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fchsd2Q3USJ8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fchsd2Q3USJ8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fchsd2Q3USJ8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fchsd2Q3USJ8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fchsd2Q3USJ8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fchsd2Q3USJ8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fchsd2Q3USJ8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fchsd2Q3USJ8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fchsd2Q3USJ8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fchsd2Q3USJ8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms