Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Acsf3Q3URE1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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Acsf3Q3URE1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Acsf3Q3URE1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Acsf3Q3URE1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Acsf3Q3URE1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Acsf3Q3URE1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acsf3Q3URE1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms