Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms