Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms