Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnep1r1Q3UJ81 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms