Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Gm648Q3UJ22 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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