Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Greb1Q3UHK3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms