Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf44Q3UHJ8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms