Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mier3Q3UHF3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mier3Q3UHF3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms