Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc58Q3UGP9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms