Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsph3aQ3UFY4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph3aQ3UFY4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph3aQ3UFY4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms