Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms