Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U7U4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U7U4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3U7U4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3U7U4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3U7U4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3U7U4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms