Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec24aQ3U2P1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec24aQ3U2P1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec24aQ3U2P1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec24aQ3U2P1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec24aQ3U2P1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec24aQ3U2P1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec24aQ3U2P1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec24aQ3U2P1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec24aQ3U2P1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec24aQ3U2P1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec24aQ3U2P1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec24aQ3U2P1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec24aQ3U2P1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec24aQ3U2P1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec24aQ3U2P1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec24aQ3U2P1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec24aQ3U2P1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec24aQ3U2P1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec24aQ3U2P1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec24aQ3U2P1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec24aQ3U2P1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec24aQ3U2P1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec24aQ3U2P1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec24aQ3U2P1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec24aQ3U2P1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec24aQ3U2P1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec24aQ3U2P1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec24aQ3U2P1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec24aQ3U2P1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec24aQ3U2P1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms