Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms