Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUH1

Tamm41, Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tamm41Q3TUH1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tamm41Q3TUH1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tamm41Q3TUH1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tamm41Q3TUH1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tamm41Q3TUH1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tamm41Q3TUH1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tamm41Q3TUH1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tamm41Q3TUH1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tamm41Q3TUH1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tamm41Q3TUH1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tamm41Q3TUH1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tamm41Q3TUH1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tamm41Q3TUH1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tamm41Q3TUH1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tamm41Q3TUH1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tamm41Q3TUH1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tamm41Q3TUH1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tamm41Q3TUH1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms