Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q3TTJ4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms