Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms