Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RubcnlQ3TD16 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RubcnlQ3TD16 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RubcnlQ3TD16 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RubcnlQ3TD16 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RubcnlQ3TD16 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RubcnlQ3TD16 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms