Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms