Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

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Length 5,193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ush2AQ2QI47 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ush2AQ2QI47 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ush2AQ2QI47 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ush2AQ2QI47 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ush2AQ2QI47 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ush2AQ2QI47 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ush2AQ2QI47 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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