Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrna5Q2MKA5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms