Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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