Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Myo3bQ1EG27 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo3bQ1EG27 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo3bQ1EG27 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo3bQ1EG27 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo3bQ1EG27 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo3bQ1EG27 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo3bQ1EG27 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo3bQ1EG27 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo3bQ1EG27 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms