Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Rpusd3Q14AI6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Rpusd3Q14AI6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Rpusd3Q14AI6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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