Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms