Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gli2Q0VGT2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms