Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms