Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBB0

Prelid2, PRELI domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid2Q0VBB0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid2Q0VBB0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prelid2Q0VBB0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms