Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r181Q0P547 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms